早在2011年日本“3·11”大地震期间，日本自卫队就首次临时编组联合任务部队。由于“统合幕僚长”忙于向首相和防卫大臣汇报和解释，以致在自卫队运用上投入的时间和精力不足。一些自卫队高官主张，“统合幕僚长”应专注于辅助防卫大臣，需新设专职指挥自卫队的“统合作战司令部”。然而，美国对日本发展军事能力“既用又防”，并未同意这一构想。
随着美国推行“大国竞争”战略并对日本逐步军事松绑，2022年12月，日本政府发布新版《国家安全保障战略》等安保文件，明确提出将成立“统合作战司令部”。美国对此表示欢迎，认为这有助于自卫队建立更有效的指挥和控制关系，提高与美军的互操作性。2023年4月，日本自卫队“统合幕僚长”吉田圭秀明确了“统合作战司令部”和“统合幕僚监部”的权责划分：前者负责战役层级的联合作战构想运用，后者负责辅佐防卫大臣作出决策等战略层级任务。
今年2月，日本政府通过《自卫队法》修改案，重申自卫队将成立常设机构“统合作战司令部”。随后，日本借吉田圭秀身体有恙，多次炒作加速成立“统合作战司令部”，以分担“统合幕僚长”职责的必要性与迫切性。在此背景下，今年4月，日本《防卫省设置法》修正案在众议院全体会议上开始审议，并最终在国会两院相继获得通过。
深度绑定美国引争议
报导称，日本设立“统合作战司令部”，不仅可加强自卫队的协调和指挥，还能促进美日军事指挥系统一体化，而这正中美国下怀。近年来，美国不断谋划高端常规战争，并将联手盟友共同干预地区乃至全球事务作为必选项。拜登政府不断深化拓展美日同盟关系，防务领域合作从战略层级向战役战术层面延伸。针对日本设立“统合作战司令部”，美国“2024财年国防授权法案”要求加速调整驻日美军指挥机构，以有效协调美日联合作战。
目前，位于横田基地的驻日美军司令部，仅负责与日本政府和自卫队之间的事务性谈判以及相关协调工作，在日美军事合作中更多扮演行政角色，司令通常由美空军第5航空队司令兼任。驻日美军各军种部队的作战指挥权，则由位于夏威夷的美军印太司令部直接掌控。
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