完成筛选后，研究人员决定使用他们的新数据集来检查一些生物学问题。最明显的应用是首先研究具有未知功能的基因。
由于新测序读出了许多已知基因的表型，研究人员可使用这些数据将未知基因与已知基因进行比较，并寻找相似的转录结果，这可能表明基因产物会作为更大复合体的一部分协同工作。
一个名为C7orf26的基因的突变尤为突出。研究人员注意到，去除导致相似表型的基因是称为整合子的蛋白质复合体的一部分，该复合物在产生小核RNA中发挥作用。整合子复合体由许多较小的亚基组成，之前的研究表明有14种单独的蛋白质，研究人员此次证实C7orf26是复合体的第15个组成部分。
他们还发现15个子单元在更小的模块中协同工作，以在整合子复合体中执行特定功能。
筛选正确分离DNA的因子
Perturb－seq的另一个好处是，由于该分析侧重于单细胞，研究人员可使用这些数据来查看更复杂的表型，这些表型在与来自其他细胞的数据一起研究时通常会变得混乱。
研究人员发现，导致细胞间不同结果的基因子集是染色体分离的原因。这种分离会导致细胞丢失一条染色体或获得一条额外的染色体，这种情况称为非整倍性。
韦斯曼表示：“你无法预测失去这个基因的转录反应是什么，因为它取决于你获得或失去的染色体的次要效应。我们意识到，这个局面其实是可以扭转的，创造这种复合表型，寻找获得或丢失的染色体特征。通过这种方式，我们对正确分离DNA所需的因子进行了第一次全基因组筛选。” |
