合并将对市场带来哪些影响？中金公司分析师李求索指出，两板合并对市场中短期影响可能有限。2月5日深主板和中小板宣布计划合并后3个交易日内中小板指上涨7.4%，略好于同期沪深300表现（同期涨幅5.9%）。3月31日宣布即将合并至今中小板指上涨2.5%，同样略好于同期市场表现（沪深300涨幅2.2%）。考虑到投资者对本次合并预期可能已经较为充分，且本次合并仅对部分事项进行适应性调整，不会对上市公司上市与运营、投资者交易习惯与行为、市场产品构建与运作产生实质影响，对固定收益类、期货期权类产品和深港通业务等也基本没有影响。板块合并不会对深主板和中小板指数的编制方法作实质性变更。因此预计深市两板合并有望平稳实施，对市场运行、市场情绪和股市表现影响有限。
对于企业发行上市，合并后，主板发行上市条件与原中小板一致，且保持不变；发行审核安排不变，在审企业无需重新申报材料，不会对企业发行上市产生实质影响。光大证券分析师王一峰指出，合并不会导致市场扩容情况发生。两板块合并后，市场交易机制及投资者门槛等均不会发生变化，对已上市公司的基本面及其股票的流动性等方面不会造成影响，不会影响已上市公司估值水平的变化。
开源证券中小盘首席分析师任浪指出，在众多基本面指标上，中小板与主板的界限较为模糊。在盈利能力方面，中小板介于创业板和深市主板之间，但与深市主板非常接近。2019年深市主板、中小板、创业板公司的毛利率平均为24.7%、24.2%、28.2%，净利率均值为5.8%、4.6%、4.8%。成长性方面，深市主板和中小板的差别相较创业板而言同样较低。深市主板、中小板、创业板公司的2017－2019年营业收入年均复合增长率平均值分别为10.4%、11.3%、13.8%，同期净利润年均复合增长率平均值分别为10.8%、12.2%、19.4%。
任浪提出，合并对投资者实际影响有限，对资本市场建设具有重要意义。合并后，深市主板的IPO功能将得以恢复，深市“主板＋创业板”的竞争力有望明显强化，将与沪市“主板＋科创板”的结构形成错位竞争，从而有利于形成更为是高效、明晰的多层次资本市场体系。
深市主板和中小板合并后，注册制的全面铺开仅剩沪深主板，这也为全面实行股票发行注册制进行准备。市场开始对全面注册制的加快落地展开想象。
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