台湾问题今后仍是存在于中日之间的焦点问题之一，台日关系今后仍然是一对不规则的双边关系与日本介入台海事务的具体“抓手”。自2016年5月民进党再次执政以来，在台日“合力抗中”目标下的双边互动中，日本始终居于主导区位，其自身获益和回旋余地明显高于台湾。随着2020年9月安倍辞职与安倍色彩浓厚的菅义伟内阁成立，后安倍时代台日关系走势又呈悬念。
2020年1月11日，蔡英文再次当选台湾地区领导人，当天，日本外务大臣茂木敏充表示祝贺。1月 12日，自民党国会议员岸信夫、日台交流协会会长大桥光夫等多位日本政客赴台祝贺。1月17日，“日（华）台议员恳谈会”会长古屋圭司在台北对蔡英文呈递时任首相安倍晋三以自民党总裁身分的亲笔贺函，恭喜蔡英文连任。
1月20日，时任首相安倍在国会施政演说中谈及东京奥运会时表示，日本政府把今年奥运会定位为“复兴奥运”，有许多城市将分别接待各地好手，其中岩手县野田村是“台湾接待城”。台湾“外交部”迅速回应称，乐见台日关系正面发展，预祝东京奥运会圆满成功。《日本产经新闻》称，与日本没有“邦交”的“台湾”一词在首相的施政演说被提及，实属罕见。上一次是2006年1月20日，时任日本首相小泉纯一郎在施政方针演说时举例说明前一年访日外籍旅客增加的要因，称是因为对台湾实施免签措施。报道分析认为，安倍此举是对中国的一种牵制。
2020年5月19日，日本外务大臣茂木敏充在内阁会议上提交2020年版《外交蓝皮书》，将台湾从“重要伙伴”的定位提升为“极为重要的伙伴”，而且较2019年版约增加1页左右的对台湾问题的描述。《蓝皮书》自2017年以来首次称“一贯支持台湾以观察员身份参加世界卫生大会（WHA）”。
5月 20日，时任日本官房长官菅义伟祝贺蔡英文第二次就任台湾地区领导人。由于受疫情影响不克赴台参加蔡英文就职典礼，岸信夫率领“日（华）台议员恳谈会”事先录影向蔡英文表达祝贺。
毋庸置疑，安倍执政的近八年期间台日关系保持着“暖升”态势，有日本学者指出，自1972年台日“断交”以来，“安倍政府是对台湾最友好的政府”。如安倍在任期间与蔡英文持续保持台日首脑之间“推特对话”。如安倍30日宣布辞职后，8月31日蔡英文就在推特上对安倍大加赞赏，称他为台日关系“贡献”巨大。安倍随即推文回应称，感谢台湾朋友的温情问候，期待日台合作与交流更加深化与进步。
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