投入不足是多数企业国家重点实验室的共性问题。
“中铁隧道局集团对实验室运行高度重视，除每年投入固定资产的折旧费近700万元外，近5年来仅投入科研经费就达5100万元。”但洪开荣算了一笔账：每年光实验室50多人的工资性支出就要上千万元，为此大家要投入大量精力申报国家级、省部级项目与课题。近5年来，实验室获得国家级项目经费约2170万元。虽然这一数字已是企业国家重点实验室的“翘楚”，实验室还是必须走向社会，争取一些横向经费。
洪开荣建议，国家出台针对企业国家重点实验室的经费支持政策，对企业投入基础研究实行税收优惠，支持实验室重视应用基础理论和关键共性技术研究，同时将国有企业在国家重点实验室的科技投入经费纳入考核指标。
试点推广“贝尔实验室”群创新模式
过去一年，刘若鹏对深圳5家企业国家重点实验室进行了调研，获得了这样一组数据：通过核心底层专利布局，累计获得国内外授权专利达到2000余件，占据各领域领先地位；发表论文276篇，在包括《自然》在内的国际顶尖期刊发表论文9篇；制定国际、国家及行业标准近2000项，引领行业发展方向。
“我们这个领域一直有这么一句话，你的科学研究走得越深入，技术突破后带来的影响力和产业变革才能越大。要想大树长得高，必须得根扎得实。”刘若鹏说，一棵创新的参天大树，一定有一颗在地下生长出同样深度根茎网络的基础研究的种子，所以底层科学研究对整个科技创新企业的重大突破至关重要，也是决定性的。“这些基础研究和产品技术不一样，需要人才、科研设施投入、长时间的积累。”
刘若鹏建议，加大人才培养力度，改革人才评价体系，增强国家在前沿技术领域的人才梯队力量。
但他表示，目前工程学位授予权主要在学校，而学校的特长并不在于工程化研究，建议依托企业国家重点实验室，先行先试授予其工程硕士、博士培养权利。
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