因为级别原因，他当时被任命为核潜艇工程副总工程师，总工程师岗位空缺。当时许多工作都是摸着石头过河，大家对一些问题意见分歧很大。这时，有一个能集中大家的智慧、意见并做出决策的“总师”显得特别必要。
在进行核反应堆一回路压力设计时，最初方案中，设计人员建议将一个主要参数设置为200个大气压，该参数参考了当时苏联列宁号核动力船舶的设计资料。
“要得到一个比较合适的数据，有两种思路：一种是叠加法，将各种不确定因素叠加放大后确保安全，缺点是得到的数据会非常大；一种是统计法，综合平衡可能出现的不确定因素，但这种方法对决策者的技术把握能力提出了更高要求。”对于200个大气压的数值，曾参与核潜艇早期设计的核反应堆工程专家、中国工程院院士周永茂很理解设计人员的苦衷，因为核潜艇是高密级工程，当时又处于特殊年代，大家做事都小心翼翼。
如果选择200个大气压，意味着冷却水温度压力高，但当时我国别说核装置，就是蒸汽轮机也只有90个大气压。
在彭士禄的主持下，最终200个大气压被降至某个较低数值。
“他不迷信国外的数据，如果当时头脑发热，估计到现在也设计不出来。”周永茂说。后来苏联也证实这个数据存在错误。
因为之前没有经验，经反覆研究分析，彭士禄提出，为确保核潜艇持续航行，先建一个与海上环境条件一模一样的陆上模式堆进行模拟实验。
为了保障设备运行，中核集团中国核动力院高级工程师高星斗和同事们练就了一身过硬本领。
堆舱里面有300多个阀门，管道分3层布置。高星斗曾回忆，考试时眼睛被用黑布蒙上，上面发布命令让摸哪一个阀门，考生要在五分钟之内摸到。监考的人打着手电检查摸对了没有。
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